Home
Tools
- Search
- Colocalization
- Gene Analysis
- Gene Identification
- Small RNA Targets
- MicroRNA Targets
Description
Documentation
Citations
Downloads
Publications
History
Contact
Links
Disclaimer
For complete usage of AthaMap please enable JavaScript in the settings of your browser!
Search
Chromosome 1
Chromosome 2
Chromosome 3
Chromosome 4
Chromosome 5
Position
Exon region
Intron region
UTR region
AGI
% Restriction to highly conserved TF binding sites (0-100)
Go to graphical and table display
1 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
--------->
ZAT2
<---------
ZAT2
<---------
At4g35610
<---------
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
------>
NtERF2
--------->
DEAR3(1)
--------->
ERF1
------>
NtERF2
--------->
ABI4(1)
<---------
ATERF1(1)
------->
GAMYB
--------->
DEAR4(1)
--------->
ANAC46
--------->
DREB2C(2)
--------->
ANAC58
--------->
ANAC58
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
<---------
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
--------->
ARR14(2)
--------->
AtMYB61
--------->
At4g35610
--------->
MYB46(3)
<---------
At4g35610
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
RAP2.6(2)
<---------
ZAT2
-
<---------
ALFIN1
--------->
ABI4(1)
<xxxxxxxxxxxxxxxxx
smallRNA(si3)
<
------>
NtERF2
------>
MYB83
--------->
At4g35610
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
----
<---------
ATERF1(1)
--------->
MYB46(3)
------>
ZmHOX2a(1)
----------->
RAV1(1)
<---
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
ZAT2
-----
<---------
ALFIN1
------>
MYB46(1)
<---------
ALFIN1
--------->
ANAC46
-------
------->
LBD16
--------->
ANAC46
<---------
ALFIN1
--------->
LBD16
----------->
RAV1(2)
--------
ATERF1(1)
<---------
MYB55(2)
--------->
AtMYB61
--------->
ANAC46
------>
ZmHOX2a(1)
--------
---->
NtERF2
<xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
smallRNA(fl3)
<---------
ZAT18
<---------
ZAT2
<---------
ALFIN1
-----
ATERF1(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
ZAT18
--------->
ZAT2
--------->
ANAC46
-
ccgcctcctcctccaaacccaccaccgccaccagctccacctcctcctccgagtccacccccagcaccagctcctcctccaaaccctccacctgaaccac
7140800
------>
NtERF2
--------->
DREB2C(2)
------->
GAMYB
--------->
RAP2.6(2)
--------->
DEAR3(1)
--------->
ANAC46
--------->
MYB46(3)
------>
NtERF2
--------->
DEAR3(2)
--------->
ANAC46
------>
NtERF2
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
------>
MYB83
<---------
ALFIN1
------>
MYB46(1)
<---------
ARR14(2)
<-
<---------
ABI4(2)
--------->
ABI4(1)
--------->
ARR14(2)
<--
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
ZAT2
---
--------->
PCF2
--------->
MYB46(3)
--------->
At4g35610
---
<---------
TCP20
<---------
ALFIN1
<---------
ZAT2
<---------
At4g35610
------>
MYB83
--------->
DEAR3(1)
--------->
At4g35610
--------->
ZAT2
------>
MYB46(1)
--------->
AtMYB61
--------->
ABI4(1)
--------->
At4g35610
--------->
ANAC46
--------->
MYB46(3)
<---------
At4g35610
------>
ZmHOX2a(1)
<--
---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
--------->
ARR14(2)
<----
-------->
AtMYB61
--------->
At4g35610
--------->
DEAR3(1)
<---------
ARR14(2)
-----
---------
MYB55(2)
--------->
ANAC58
--------->
AtMYB61
------>
MYB83
<---------
ZAT2
----->
AtMYB61
--------->
ANAC58
<---------
MYB55(2)
------>
MYB46(1)
<-------
------
ALFIN1
--------->
AtMYB61
--------->
AtMYB61
<---------
MYB111(1)
--------
---->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
<---------
At4g35610
------>
ZmHOX2a(1)
--
-->
AtMYB61
--------->
ARR14(2)
--------->
DEAR3(1)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
->
MYB46(3)
<---------
ARR14(2)
--------->
AtMYB61
--------->
MYB46(3)
--------->
ANAC46
---------
-------->
MYB46(3)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
AtMYB61
<---------
ALFIN1
caccagccccaccgccaaatcctccaccagcaccaccacccccaccaagaccaccaccgctcccagctcctccaccaaatcctcctccagctccaccacc
7140900
--------->
ARR14(2)
<---------
ARR14(2)
<---------
ZAT2
--------->
ZAT2
<---------
At4g35610
------>
NtERF2
------>
NtERF2
--------->
ABI4(1)
<---------
ATERF1(1)
<---------
ALFIN1
--------->
DREB2C(2)
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR4(2)
<------
NtERF2
<---------
ATERF1(1)
--------->
ATERF1(1)
------>
NtERF2
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
ORA47(2)
<------
NtERF2
--------->
ABI4(1)
--------->
ATERF1(1)
<-----------
HVH21
--------->
DEAR4(2)
------->
GAMYB
--------->
At4g35610
--------->
RAP2.3(2)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
RAP2.3(3)
------>
ZmHOX2a(1)
------->
GAMYB
<---------
ATERF1(1)
<---------
ALFIN1
------>
NtERF2
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
--------
ARR14(2)
<---------
ATERF1(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
-------
At4g35610
--------->
AtMYB61
<---------
ATERF1(1)
--------->
RAP2.3(1)
------>
At4g35610
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
--------->
DEAR3(1)
------>
ZAT2
--------->
ANAC58
--------->
LBD16
--------->
RAP2.6(2)
-------
ZAT2
--------->
RAP2.6(2)
--------->
ANAC46
---------->
DOF2
-----
ALFIN1
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
AtMYB61
---->
MYB46(3)
--------->
ANAC46
<---------
LBD16
<xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
smallRNA(si3)
--
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
--------->
RAP2.6(2)
------>
NtERF2
---------
->
AtMYB61
--------->
ANAC58
<---------
ATERF1(1)
--------->
ANAC46
--------->
ZAT18
------->
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
------>
NtERF2
>
MYB46(3)
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
------>
NtERF2
--------->
RAP2.3(1)
--------->
AtMYB61
--
agctcctcctcctaaaccgccaccgcctccagctcctccgccaagaccgcctcctccaccaaagccgcctcctccaccaagaccactgcctccaccaata
7141000
<------
MYB46(1)
------>
NtERF2
<---------
ALFIN1
<------
MYB83
--------->
MYB46(3)
<---------
MYB46(3)
<<<<<<<<<<<<<<<<<
LFY
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
AtMYB61
<---------
MYB52(1)
<---------
ATERF1(1)
----------->
RAV1(2)
<---------
ZAT2
------>
NtERF2
--------->
DEAR3(1)
--------->
HSFB2a(2)
<-----------
HVH21
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
<---------
ALFIN1
<----------
DOF2
--------->
ZAT2
<---------
ALFIN1
>
AtMYB61
--------->
AtMYB61
<---------
ARR11(3)
<---------
At4g35610
---->
NtERF2
<---------
ARR11(3)
--------->
ARR11(3)
--------->
At4g35610
--
ccgcctcctccaccgagacctccgcctggatggtggaagaatgtcttttggtcctcgagaccactcttcagcttcctgttagcgacactggcaaatgaag
7141100
<---------
RAP2.6(3)
------>
NtERF2
--------->
RAP2.3(3)
--------->
DREB2C(2)
--------->
RAP2.3(2)
--------->
DEAR3(1)
<---------
ANAC58
--------->
RAP2.6(2)
<---------
ANAC46
----------->
HVH21
<---------
bZIP60(2)
<---------
ETT(1)
<---------
ANAC58
--------->
DEAR3(2)
--------->
ANAC58
--------->
RAP2.3(1)
---------->
DOF2
--------->
At4g35610
--------->
ANAC58
---------->
DOF2
----------->
RAV1(1)
--------->
ANAC58
--------->
ICU4
---------->
DOF2
<----------
ID1
<-----------------------
TaNAC69(2)
<---------
YAB1
---
--------->
ANAC58
--------->
ANAC58
----------->
GT1
<---------
ANAC58
--------->
GLK1(1)
--------->
ANAC58
--------->
ANAC58
--------->
DAG2
<---------
ANAC46
<------
ZmHOX2a(1)
-------->
DOF2
<xxxxxxxxxxxxxxxx
smallRNA(i)
--------->
ANAC58
<---------
ANAC58
*
TSS
<-------
tgaaagcaaaagagccgacaagtaaggcaacaagaaagagtgacttggaagccatgtcgatttttgtgttttgcgtatgtgatgat
gaggaactctatca
7141200
<--
---
<-----------
TBP
<-----
<-----------
TBP
------
----------->
GT1
<------
--------->
DAG2
--------->
At4g35610
<--------
<---------
TOE2(3)
--------->
ZAT2
--------->
AHL20(2)
---------
<---------
ATHB12
<---------
ANAC58
<------------
CBF
<---------
ZAT6
-----
--------->
CBF
<---------
ANAC58
------------>
CBF
----------->
GT1
----------->
GT1
----
HVH21
--------->
AHL20(2)
<---------
At4g35610
---------->
DOF2
---------->
DOF2
--------->
ICU4
gccaataaggtgtttatatagaccatttggcatgagctgaagaatcaaacaattgaataaaaagagggagagagtaaagttttagagtgagtaattatca
7141300
--------->
At4g35610
<---------
At4g35610
----------->
RAV1(2)
--------->
ZAT14
=============================
RAV
<---------
ZAT6
-------
AHL20(2)
<---------
MYB111(2)
------>
AHL20(2)
--------->
MYB46(3)
---
HAHB4
<---------
MYB111(1)
--->
YAB1
<---------
AHL20(2)
--------->
ALFIN1
<-------
MYC3
---
YAB1
<---------
AHL20(2)
-------->
P
------->
MYC3
-
ICU4
--------->
AHL20(1)
--------->
MYB52(1)
<---------------
AGL15
>
YAB1
--------->
AHL20(2)
>>>>>>>>>>>>>>>>>
LFY
--------------->
AGL15
---->
TOE2(3)
<-----------
RAV1(1)
<---------
MYB46(2)
<-----------
GT1
<-
ttaattcatctgcccatctaattcatgttggcaaatttaatgcaatccctaactaccagtgttgacaaacatgttactcatccacatgtagtagacccct
7141400
<---
<-----
<------
NtERF2
------
<----------
DOF2
--------->
At4g35610
<-------
--------------->
AtSPL8
<---------
ANAC58
--------->
ZAT14
--------->
ARR11(3)
<---------
ZAT6
<---------
ANAC58
<---------
ZAT14
<---------
ARR11(3)
<----------
DOF2
--------------->
AtSPL8
--------->
AHL20(2)
--------->
GLK1(2)
-----
---------
DOF2
<---------------
AtSPL8
<---------
AHL20(2)
------->
TEIL
<---------
TOE2(3)
tctttattctttgtgttagtactacttaatagtactcattttcttgcctttcacatttaaatttggctgcagtatttgatgaatctgagattttagatta
7141500
<---------
TOE2(3)
---------->
DOF2
--------->
LBD16
<---------
YAB1
<---------
LBD16
--------->
ATHB51
------
YAB1
<---------
TOE2(3)
<---------
ICU4
----
KAN4(1)
<---------
AHL20(2)
<--------
HAHB4
--->
KAN4(1)
--------->
AHL20(2)
--------->
ICU4
--
GLK1(2)
----------->
HVH21
--------->
ZAT18
---->
KAN4(2)
--------->
LBD16
<---------------
AtSPL8
<---------
YAB1
ttcttatgtccggagaccggagttatttaatgtttttgttaatgtgttttttagtacattttggtgtccaccattattaaagaaaacaacaacaaggtat
7141600
<---------
AHL20(2)
--------->
AHL20(2)
--------->
ICU4
<---------
ATHB51
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
<---------
ANAC58
<---------
ICU4
<-----------
GT1
--
<---------
YAB1
--------->
ANAC46
--------->
ICU4
--------->
ZAT6
<---------
ANAC46
<---------
ICU4
<-----------
GT1
--------->
YAB1
--------->
AHL20(1)
<---------
ANAC58
ctatattttcatgtttacgataaataaactttacacattacattggaagagaataataagtatgaaataatttgttttcactacatttcttgacttggac
7141700
Previous
Next
AGI:
At3g20470.1
Description:
pseudogene, glycine-rich protein, identical to a region of GB:JQ1064 from (Arabidopsis thaliana) ( Plant Cell 2 (5), 427-436 (1990))
Range:
from: 7140446
to: 7141186
Orientation: Reverse
Links:
TAIR
MIPS
Please cite the corresponding
publications
when using AthaMap.
printer-friendly version