Search
Chromosome 1
Chromosome 2
Chromosome 3
Chromosome 4
Chromosome 5
Position
Exon region
Intron region
UTR region
AGI
% Restriction to highly conserved TF binding sites (0-100)
Go to graphical and table display
1 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
<----------
DOF2
<---------
ARR11(3)
--------->
ARR11(3)
<
->
DAG2
<-----------
GT1
<
->
DOF2
<-----------
GT1
-
--
AGL15
<<<<<<<<<
TBF1
----------->
GT1
<
->
AGL15
--------->
TOE2(3)
<---------
YAB1
<---------
WOX13(1)
------>
ZmHOX2a(1)
<---
caagttctttaaaaaccatagactttcttcttcattcttgaaccatttgatagatggcaaatttttctctcttcctcttaaaaatggagttgtttctctg
589600
<-----------
GT1
<-----------
TGA1
<---------
ANAC46
---------
ANAC58
<---------
MYB46(3)
---------
bZIP60(1)
<-----------
RAV1(1)
---------
-------->
bZIP60(1)
<-----------
RAV1(1)
---------
---------
ANAC58
--------->
GLK1(2)
<--------
------
MYB52(1)
--------->
YAB1
<---------
AtLEC2
--------->
ZAT18
--------->
ALFIN1
tttcgtcactctgtttttactatcacaatctgttgttgcattgagtataacagagaaacaagagattgaatgtgcaatgtgtttagagtgtgagaatcca
589700
--------->
AtMYB61
--------->
ZAT6
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
--------->
DEAR3(1)
<---------
ATERF1(1)
------>
NtERF2
--------->
LBD16
--------->
DEAR3(1)
--------->
ANAC58
<---------
ALFIN1
--------->
DEAR3(1)
--------->
ANAC46
--------->
ANAC46
------>
NtERF2
------>
NtERF2
--------->
ANAC58
<---------
ATERF1(1)
--------->
DEAR3(1)
<---------
LBD16
------>
NtERF2
<---------
ATERF1(1)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
ABI4(1)
<-----------
HVH21
<---------
ATERF1(1)
<---------
ALFIN1
--------->
ANAC46
<---------
ALFIN1
------->
GAMYB
------>
ZmHOX2a(1)
------>
NtERF2
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
<---------
ATERF1(1)
--------->
DREB2C(2)
<---------
ATERF1(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR4(2)
--------->
RAP2.6(2)
------>
NtERF2
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
<---------
MYB55(2)
<-
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
--------->
At4g35610
--------->
ANAC46
--------->
AtMYB61
<---------
ALFIN1
<---------
At4g35610
--------->
DEAR3(1)
---------->
ID1
--------->
AtMYB61
<-
--------->
At4g35610
<------
NtERF2
<---------
ALFIN1
<---------
GLK1(1)
--------->
MYB46(3)
--
>
GLK1(2)
--------->
bZIP60(2)
<---------
ATERF1(1)
<<<<<<<
ZML2
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
>
ARR14(2)
--------->
AtMYB61
<---------
ALFIN1
------>
NtERF2
<----------
DOF2
-------->
P
--------->
AtMYB61
-
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
--------->
ANAC46
----------->
RAV1(1)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
tgtga
tcagccacctcctccgtcgccttcccctccgcctcctccgccaccactagaactcctttgtcctccaccgctaccaccgcctccaccccccttag
589800
<---------
ALFIN1
--------->
DEAR3(1)
--------->
DREB2C(2)
------->
GAMYB
--------->
MYB46(3)
--------->
ATERF1(1)
<------
NtERF2
--------->
ORA47(2)
--------->
DEAR4(2)
------>
NtERF2
--------->
ABI4(1)
<---------
ATERF1(1)
<
--------->
DEAR3(1)
<--
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---
--------->
AtMYB61
--------->
DEAR3(1)
-----
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
<----
------>
NtERF2
--------->
MYB46(3)
-------
<---------
ATERF1(1)
--------->
ANAC46
------>
NtERF2
<------
NtERF2
--------->
AtMYB61
------->
GAMYB
--------->
ANAC46
<---------
ALFIN1
--------
--------->
ANAC58
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
AtMYB61
--------
--------->
ANAC58
--------->
AtMYB61
--------->
MYB46(3)
<-------
--------->
SPL7
--------->
DEAR3(1)
------>
ZmHOX2a(1)
---------
<-----------
HVH21
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
At4g35610
<-----------
GT1
--------->
ANAC46
<---------
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
<---------
At4g35610
--------
ARR11(3)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
AtMYB61
--------->
DEAR3(1)
---------
--------
GLK1(2)
------>
NtERF2
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
------->
ARR11(3)
<---------
DAG2
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
REM1(1)
<-----------
GT1
------>
NtERF2
---
agattttctgtccgccaccgccttctccaccacctccttctcctcctcctccttcaccaccaccaccatgtaaccactgccccttgccgcttccaccgcc
589900
<---------
ANAC58
<---------
ANAC46
<---------
ANAC58
<---------
ZAT2
--------->
ZAT2
<------
NtERF2
<---------
DEAR3(2)
------>
NtERF2
--------->
ATERF1(2)
--------->
RAP2.3(2)
--------->
RAP2.3(3)
--------->
DREB2C(2)
<---------
DEAR3(1)
<---------
ATERF1(2)
--------->
DEAR3(1)
--------->
ATERF1(1)
<------
NtERF2
--------->
DEAR4(2)
--------->
ORA47(2)
<---------
LBD16
--------->
RAP2.3(1)
--------->
ANAC46
<---------
RAP2.3(1)
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
--------->
LBD16
<---------
ATERF1(1)
--------->
At4g35610
--------->
ATERF1(2)
----------->
RAV1(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
RAP2.3(2)
<---------
ATERF1(2)
--------->
DEAR3(1)
--------->
RAP2.3(1)
--------->
RAP2.6(2)
--------->
ATERF1(1)
<---------
YAB1
----------->
HVH21
<---------
RAP2.6(2)
<---------
ICU4
--------->
LBD16
---------
ATERF1(1)
--------->
ICU4
<---------
HSFB2a(1)
-------
MYB52(1)
<---------
YAB1
--------->
HSFB2a(1)
----
GAMYB
--------->
YAB1
<---------
HSFC1(2)
---->
DEAR3(1)
<--------
HAHB4
--------->
At4g35610
-----
MYB46(3)
<---------
ICU4
<------
NtERF2
-->
ABI4(1)
--------->
AtMYB61
<---------
At4g35610
->
DREB2C(2)
--------->
LBD16
<---------
ATHB12
--------->
HSFC1(2)
->
DEAR3(1)
<---------
ANAC46
--------->
DEAR3(1)
<-----------
RAV1(2)
--
ALFIN1
<-----------------------
TaNAC69(2)
--------->
RAP2.3(1)
--------->
At4g35610
>
MYB46(3)
<---------
ATHB12
--------->
MYB46(3)
--------->
At4g35610
<---------
GLK1(1)
>
DEAR3(2)
--------->
ICU4
<---------
ABI4(2)
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
----
------>
ATERF1(1)
------->
TEIL
---------->
DOF2
<------
ZmHOX2a(2)
<-----------
ARR10
<---------
At4g35610
gttgccgccggcttgcaatgaatgtgttccgaataagccgagaccaccgatcattatcacagccgcagaagcttccccgacgatttctgcttccat
cagt
590000
<---------
WOX13(1)
<-----------
RAV1(1)
<---------
TOE2(3)
<---------
ICU4
---
--------->
YAB1
------>
ZmHOX2a(2)
<---------
YAB1
<------------
CBF
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
REM1(1)
<---------
At4g35610
--------->
ICU4
<---------
ICU4
<---------
ZAT18
<---------
ATHB51
--------->
ARR11(3)
<---------
MYB52(1)
--------->
ATHB12
--------->
ZAT18
<---------
ATHB12
<---------
ARR11(3)
<-------
GAMYB
<---
----->
ZAT14
<----------
DOF2
------------>
CBF
<------------
CBF
<-----------
RAV1(1)
<---------
YAB1
ttagttattgctctcgtctttctagtgtcctctctgtttcaataatgttgtagcgattgatcttcagctatttgttgtctctccgttattattcttacat
590100
<---------
AHL20(2)
--------->
AHL20(2)
------>
ZmHOX2a(2)
>>>>>>>
ZML2
=============
HOX2a_HOX2a
<---------
HSFB2a(2)
<---------
ARR11(3)
--------->
HSFC1(1)
--------->
ARR11(3)
---------->
DOF2
--------->
HSFB2a(2)
<---------
HSFB2a(2)
<---------
ARR11(3)
------>
YAB1
<---------
HSFC1(1)
<-----------
GT1
<------------
CBF
--------->
ARR11(3)
----
TEIL
------------>
CBF
<------
ZmHOX2a(1)
--------->
HSFB2a(2)
------>
ZmHOX2a(1)
-----
tcataaagaaattcaatttctggttctaggaaattatatatgtttactcttctgtaacccattgatctctccttcagtagcaaggtctctagtatttatc
590200
<---------
AHL20(2)
--------->
AHL20(2)
--------->
MYB52(1)
--------->
TOE2(3)
--------->
YAB1
--------->
TOE1(3)
--------->
YAB1
<----------
DOF2
--------->
ZAT6
<---------
YAB1
<---------
ATHB12
--------->
YAB1
<---------
YAB1
<----------
DOF2
<---------
ARR11(3)
---->
YAB1
------------>
CBF
---------->
DOF2
<---------
DAG2
--------->
ARR11(3)
agaatgatataaaacaatagtgagattataaaagtaaaccttttagttttcagttttgctttatctctacgatttgattatcttaacgaataaatcatgt
590300
<---------
ARR14(2)
--------->
ARR14(2)
<---------
At5g28300
<------
ZmHOX2a(1)
<-----------
GT1
--------->
CCA1(2)
<---------
ICU4
<---------
ARR11(3)
<----------
DOF2
<--------
--------->
ARR11(3)
<---------
MYB52(1)
--------->
YAB1
-
gtataaacgagtttttctcaatatatggagcaagtaggatactcaaatagctatagttgtgccattactttgatttttactgtcttaatcgtattttaag
590400
<----------
DOF2
--------->
MYB111(2)
--------->
MYB52(2)
--------->
MYB46(2)
--------->
MYB111(1)
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
--------->
ANAC46
<---------
MYB46(3)
--------->
ANAC58
<--------
P
<----------
DOF2
--------->
GLK1(1)
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
<---------
ARR14(2)
<---------
AHL20(1)
----
<---------
ICU4
----------->
GT1
--------->
AHL20(1)
<-----
-
AHL20(2)
<<<<<<<<<<
MYB80
---------->
DOF2
--------->
ANAC58
<---------
WOX13(1)
---------
-------->
ICU4
--------->
YAB1
--------->
ARR14(2)
<---------
AHL20(2)
--------->
ATHB12
<<<<<<
tgctaattactttggtttgacaaactataacaaaaatcgcaaatatccaagaaaatcgaaatttaattggtagttactttgatttgacaaactatattaa
590500
Previous
Next
AGI:
At1g02710.1
Description:
glycine-rich protein
Range:
from: 589706
to: 589996
Orientation: Reverse
Links:
TAIR
MIPS
Please cite the corresponding
publications
when using AthaMap.