Home
Tools
- Search
- Colocalization
- Gene Analysis
- Gene Identification
- Small RNA Targets
- MicroRNA Targets
Description
Documentation
Citations
Downloads
Publications
History
Contact
Links
Disclaimer
For complete usage of AthaMap please enable JavaScript in the settings of your browser!
Search
Chromosome 1
Chromosome 2
Chromosome 3
Chromosome 4
Chromosome 5
Position
Exon region
Intron region
UTR region
AGI
% Restriction to highly conserved TF binding sites (0-100)
Go to graphical and table display
1 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
--------->
AtMYB61
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
--------->
AtMYB61
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
AtMYB61
--------->
ARR14(2)
--------->
DEAR3(1)
<---------
ARR14(2)
--------->
MYB46(3)
<---------
MYB55(2)
--------->
DEAR3(1)
<---------
HSFB2a(2)
--------->
MYB46(3)
--------->
AtMYB61
------>
ZmHOX2a(1)
-------->
ANAC46
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
-------->
ANAC58
<---------
ALFIN1
<---------
HSFB2a(2)
------>
NtERF2
----->
MYB46(1)
--------->
AtMYB61
------->
GAMYB
----->
MYB83
--------->
MYB46(3)
--------->
MYB46(3)
-------->
ANAC58
--------->
AtMYB61
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
ARR14(2)
<
------>
DEAR3(1)
--------->
MYB46(3)
--------->
HSFB2a(2)
<---------
ALFIN1
--------->
HSFB2a(2)
-
------>
AtMYB61
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
------
-------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
------>
ZmHOX2a(1)
----->
MYB46(3)
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
<---------
ALFIN1
----
ALFIN1
<---------
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
--------->
At4g35610
<---------
ALFIN1
ccacccaatccacctcctcctcctaaaccaccaccaccaccacctcctagaccccctcctcctcccaaaccgctaccgcctcctagaccccctcctcctc
13871300
<------
NtERF2
------>
NtERF2
--------->
DREB2C(2)
--------->
RAP2.3(2)
--------->
RRTF1(2)
--------->
RAP2.6(2)
--------->
RRTF1(3)
--------->
ATERF1(2)
--------->
RAP2.3(3)
<---------
ATERF1(2)
--------->
ORA47(2)
--------->
RAP2.3(1)
--------->
RRTF1(1)
--------->
DEAR4(2)
--------->
ERF1
--------->
ABI4(1)
--------->
ATERF1(1)
--------->
AtMYB61
--------->
ABI4(1)
<---------
ALFIN1
------>
NtERF2
--------->
DEAR3(1)
<---------
ATERF1(1)
<---------
ABI4(2)
-
--------->
ANAC46
--------->
ANAC46
--------
<---------
ALFIN1
--------->
ANAC58
<---------
HSFB2a(2)
--------->
DEAR3(1)
--------->
ANAC58
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
AtMYB61
<---------
ATERF1(1)
------>
NtERF2
-
--------->
ABI4(1)
------>
NtERF2
<---------
MYB55(2)
-
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
--------->
ABI4(1)
<---------
ATERF1(1)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DREB2C(2)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
HSFB2a(2)
<---------
HSFB2a(2)
--------->
DEAR3(1)
------>
NtERF2
------->
GAMYB
<
------>
NtERF2
--------->
DREB2C(2)
--------->
DEAR4(2)
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
<xxxxxxxxxxxxxxxxxxx
smallRNA(le3)
--------->
ABI4(1)
------->
GAMYB
------>
NtERF2
<-------
------>
NtERF2
<---------
ALFIN1
--------->
DEAR3(1)
--------->
DREB2C(2)
------>
NtERF2
-
------->
GAMYB
--------->
AtMYB61
<---------
ALFIN1
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
--
--------->
DEAR3(1)
------->
GAMYB
--------->
AtMYB61
<---------
ALFIN1
--------->
ABI4(1)
-----
<---------
ATERF1(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
MYB55(2)
--------->
ORA47(2)
<---------
ALFIN1
<-
--------->
At4g35610
--------->
MYB46(3)
--------->
MYB46(3)
--------->
MYB46(3)
--------->
DREB2C(2)
<
--------->
MYB46(3)
<---------
MYB55(2)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
-----
---------
ALFIN1
--------->
HSFB2a(2)
--------->
ANAC46
--------->
AtMYB61
--------->
MYB46(3)
<----
-------->
ARR14(2)
--------->
AtMYB61
--------->
AtMYB61
--------->
AtMYB61
--------->
RAP2.6(2)
------
>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
DEAR3(1)
------->
GAMYB
<---------
ATERF1(1)
--------->
DEAR4(2)
--
ccaaaccgctaccgcctcctagaccaccaccgccgcctaaacctccaccaccgcctaaacctccaccgcctcctaggccaccaccgcctcctagaccacc
13871400
<---------
WRKY18(1)
<------
NtERF2
------>
NtERF2
--------->
RAP2.3(3)
--------->
RRTF1(2)
--------->
DREB2C(2)
--------->
RAP2.3(2)
--------->
ATERF1(2)
--------->
RRTF1(3)
--------->
DEAR3(1)
<---------
ATERF1(2)
--------->
RAP2.6(2)
--------->
RAP2.6(1)
--------->
RRTF1(1)
--------->
DEAR4(2)
<---------
ALFIN1
--------->
RAP2.3(1)
------>
NtERF2
--------->
ERF1
--------->
ORA47(1)
--------->
ORA47(2)
--------->
ABI4(1)
--------->
ATERF1(1)
--------->
DREB2C(2)
-------->
LBD16
--------->
DEAR3(1)
->
AtMYB61
------->
GAMYB
----->
NtERF2
--------->
ORA47(2)
-------->
At4g35610
--------->
ANAC46
---------
At4g35610
--------->
DEAR3(2)
--
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
-------->
ABI4(1)
--------->
AtMYB61
------->
DEAR3(1)
<---------
ALFIN1
---->
DEAR3(1)
--------->
MYB46(3)
--------
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
<---------
ANAC58
---------
ATERF1(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
ANAC58
---->
AtMYB61
--------->
DEAR3(1)
<---------
ANAC58
----------->
GT1
-----
ALFIN1
<---------
ATERF1(1)
<---------
ANAC46
<---------
TOE1(1)
<---
--->
ZAT2
--------->
RAP2.6(2)
<---------
ANAC58
<------
ZmHOX2a(1)
--------->
ICU4
------->
ANAC46
------>
NtERF2
<----------
DOF2
<---------
YAB1
<---------
TOE2(1)
<---
tccgccgcctagaccgcctccaccgcccaaacccttaccgaaacctttcttgtaaatgccatgcttgtggaggaatggacgaggtttgtgtaaaaatgga
13871500
---
----
----
<---
----
-----
<----
------>
MYB83
------>
MYB46(1)
--------->
ANAC58
--------->
ANAC58
--------->
ANAC46
--------->
TOE2(3)
--------->
ANAC58
--------->
TOE1(3)
<---------
ALFIN1
<---------
DOF5.7(2)
--------->
CCA1(2)
<----
--------->
DAG2
<---------
MYB52(1)
--------->
ANAC58
---------->
DOF2
-------
---------->
DOF2
--------->
DOF5.7(2)
--------->
SPL7
<---------
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
------
TOE1(1)
<------
NtERF2
<---------
GLK1(1)
--------->
ARR14(2)
--------->
ANAC46
------
TOE2(1)
---------->
ID1
<---------
ICU4
<---------
At4g35610
--------->
YAB1
---------
cgaggtttgtggaaaaagtgtttgtcgtcgttaacctcaacatttccgaacgaaaattcagcgactagagcgaatacaaagataaacacacacaccttcc
13871600
--------->
MYB52(2)
------>
LBD16
<---------
ICU4
----->
LBD16
--------->
ATHB51
----->
HSFB2a(2)
<-----------
GT1
------
HSFB2a(2)
--------->
MYB52(1)
----->
ANAC46
<--------
HAHB4
---->
HSFB2a(2)
--------->
AHL20(2)
-----
LBD16
<---------
ATHB12
---------->
DOF2
<--
-----
HSFB2a(2)
<---------
AHL20(2)
<---------
ARR14(2)
-----
->
P
--------->
AHL20(2)
<-------
TEIL
<---------
ANAC46
<------
ZmHOX2a(2)
<-----------
HVH21
<----
>
AtMYB61
--------->
ICU4
----------->
GT1
*
TSS
<---------
MYB46(3)
<---------
WRKY18(1)
cggaaattaaacccataattaactggttcgttttatatggtgtatatgaaagag
agatcgaagacagtagttgtgtcagtgaagcttagtcttgacctct
13871700
--------->
ANAC55(2)
--------->
ANAC58
<---------
ARR14(2)
=================================================
bZIP_DOF
<---------
O2
--------->
MYB52(1)
--------->
O2
--------->
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
<---------
ARR14(2)
--------->
ZAT18
--------->
YAB1
--------->
ARR14(2)
--------->
ANAC58
--------->
ARR14(2)
<---------
ARR14(2)
<---------
ANAC55(2)
<---------
ANAC58
<---------
ANAC58
-
---------
TBP
<---------
ZAT18
--------->
ANAC46
<---------
TOE1(2)
--------->
LBD16
<---
---------->
AGL15
--------->
TGA1a
--------->
ANAC55(2)
<----------
DOF2
<---------
LBD16
-----
-----------
AGL15
<---------
TGA1a
<-------
TEIL
<---------
ANAC58
<---------
ANAC58
<----
atatatagacatatcgtccactcgtgagtacgttacatacataaccggttttgcttcttctttttctaggtttcttatcaattccggtttagtttagttt
13871800
--------->
ARR14(2)
--------->
MYB52(1)
<---------
ARR14(2)
----------->
HVH21
<---------
ANAC58
<---------
LBD16
<---------
ANAC55(2)
<---------
ARR14(2)
<------
MYB83
--------->
DAG2
<------
MYB46(1)
---------->
DOF2
--------->
ATHB12
-------->
ATHB12
<---------
ANAC58
<------
ZmHOX2a(1)
--------->
ICU4
----
GAMYB
--------->
AHL20(2)
<---------
ANAC58
<---------
MYB52(1)
--------->
LBD16
---->
MYB52(2)
<---------
ATHB51
--------->
ATHB12
------->
GAMYB
--------->
ARR14(2)
-
-----
MYB46(3)
--------->
ANAC46
<---------
MYB46(3)
<---------
ANAC58
--------->
ALFIN1
<----
gttgatttgttcatatatactcaaattattctatttcagaggttgaaatgcttggttaaggcgtaaccgtgaggaaaagtgggaaaccggaattgattaa
13871900
--------->
ZAT18
<---------
ANAC46
<---------
AHL20(2)
<---------
ANAC58
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
<-----------
HVH21
--------->
AHL20(2)
--------->
At4g35610
-
<---------
AHL20(1)
----------->
RAV1(2)
<
--------->
AHL20(1)
<---------
At4g35610
-
--------->
AHL20(2)
<-------
TEIL
<---------
AHL20(1)
<---------
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
--------->
AHL20(1)
<-----------
GT1
--------->
AHL20(2)
<---------
ZAT14
<---------
TOE2(3)
--------->
AHL20(2)
-------->
LBD16
----------->
GT1
<---------
ANAC58
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
-------
GT1
<----------
ID1
<---------
MYB46(3)
<---------
AHL20(2)
<------
ZmHOX2a(1)
<
accggacgtattaacttgtaagaaggcgaaaaaaataaattggttgagtaaactaaattaaatgaggttcacctgtcataggacaatttatttatgtctg
13872000
<---------
ARR11(3)
--------->
ARR11(3)
<-----------
RAV1(2)
===========================
RAV
--------->
YAB1
------->
GAMYB
--------->
AHL20(2)
<---------
MYB55(2)
<---------
AHL20(2)
--------->
MYB46(3)
<---------
AHL20(2)
--------->
AHL20(2)
-
<------------
AtMYB77
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
<
-------->
At4g35610
--------->
YAB1
--------->
AHL20(2)
<---------
AHL20(2)
---------
ZAT2
----------->
RAV1(1)
<-------
TEIL
--------->
AHL20(2)
--------->
AHL20(2)
-------->
ZAT2
------>
ZmHOX2a(2)
--------->
YAB1
------->
TEIL
<---------
ATHB12
<---------
AHL20(2)
---------
At4g35610
--------->
MYB46(3)
<---------
ATHB12
--------->
AHL20(2)
------->
TEIL
---
ccaactgcccagttgatctcatccaacataacaataaaaatgaaatcaatgtacatttgatgaattcaataaataaataatatcgatgtatatatatatg
13872100
----------->
GT1
--------->
ATERF1(1)
<------
NtERF2
--------->
RAP2.3(1)
<---------
ATERF1(1)
------>
NtERF2
<---------
DEAR3(1)
<---------
ABI4(2)
<---------
PCF2
--------->
ATERF1(1)
--------->
ZAT18
----------------->
AGL1
<---------
ATERF1(1)
<-----------
GT1
<---------
ZAT18
<
--------->
ARR11(3)
<---------
RAP2.3(3)
--------->
TOE2(3)
-
<---------
ARR11(3)
<---------
DEAR3(1)
--------->
TOE1(3)
-------
------>
MYC3
<---------
CCA1(2)
--------->
MYB52(1)
--------->
DEAR3(1)
<------
-------
MYC3
------->
TEIL
--------->
At4g35610
<---------
RAP2.3(1)
-------
---->
TEIL
----------->
GT1
<---------
TOE2(3)
--------->
GLK1(2)
----------->
GT1
--------
cacatgaaatgaaatgtatatcttatttccgattaagaaaatgagcaaacgattctagtgggcgccgatggtgaaaaaacctgaaattgatgaaaatata
13872200
Previous
Next
AGI:
At2g32690.1
Description:
pseudogene, glycine-rich protein
Range:
from: 13870801
to: 13871654
Orientation: Reverse
Links:
TAIR
MIPS
Please cite the corresponding
publications
when using AthaMap.
printer-friendly version