Home
Tools
- Search
- Colocalization
- Gene Analysis
- Gene Identification
- Small RNA Targets
- MicroRNA Targets
Description
Documentation
Citations
Downloads
Publications
History
Contact
Links
Disclaimer
For complete usage of AthaMap please enable JavaScript in the settings of your browser!
Search
Chromosome 1
Chromosome 2
Chromosome 3
Chromosome 4
Chromosome 5
Position
Exon region
Intron region
UTR region
AGI
% Restriction to highly conserved TF binding sites (0-100)
Go to graphical and table display
1 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
--------->
ARR14(2)
<---------
HSFB2a(1)
--------->
KAN4(1)
<---------
KAN4(1)
<---------
YAB1
--------->
GLK1(1)
--------->
YAB1
<----------
TaMYB80
--------->
ICU4
--------->
HSFB2a(1)
<---------
YAB1
<---------
GLK1(1)
<---------
ICU4
---------->
TaMYB80
--------->
YAB1
--------->
YAB1
<--
--------->
At5g28300
<---------
YAB1
<--
----------->
GT1
<---------
YAB1
<---------
KAN4(2)
----
<---------
ANAC46
--------->
ICU4
<---------
ZAT6
<---------
AHL20(2)
<---
<-----------
GT1
<---------
ZAT6
--------->
GLK1(2)
--------->
YAB1
<---------
ARR14(2)
gttttttccatagttgtgtatttagtggtaaattatgatgaaacagacaaattctagtgttacaatagattataatgttcgaatatccgttgaaatctag
6406300
--------->
TOE2(3)
<---------
ANAC55(2)
--------->
ANAC58
--------->
ANAC55(1)
--------->
ANAC55(2)
----------->
GT1
--------->
ANAC58
--------->
DAG2
<---------
YAB1
<-------
TEIL
---------->
DOF2
-------
RVE1(1)
<---------
ARR14(2)
----------->
GT1
-------
CCA1(1)
--------->
ARR14(2)
<---------
TOE2(3)
<
----->
ARR11(3)
--------->
MYB52(1)
---------->
DOF2
--------->
AHL20(2)
------
ARR11(3)
------------>
MYB.PH3(1)
---------->
DOF2
<---------------
AGL15
-----
atatttgatatgatataaaaaacggatacgtaaacttatttgaaaacaaaagaagacactaagaaaactataaacaaataaaggtaacaaaaagtaaata
6406400
--------->
ANAC55(2)
<---------
ANAC55(2)
<-----------
GT1
<---------
YAB1
<-----------
GT1
--------->
GLK1(2)
--------->
ATHB12
<---------
WOX13(1)
<-------
TEIL
<----------
DOF2
--------->
ICU4
<--
-------
TEIL
--------->
ARR11(3)
---------->
DOF2
<---------
YAB1
<----
------>
GT1
<---------
ARR11(3)
<---------
ZAT6
<----------
DOF2
--------->
ATHB12
--------->
ANAC46
gttacattcatttcaaaatcttttgttattacatgtttggaattagagtaacttaaaagctttatagtttatattgattaatacaactcatacacatccc
6406500
<---------
AGP1
--------->
ARR14(2)
<---------
ARR14(2)
<---------
At4g35610
<-----------
HVH21
<--------
>>>>>>>>>>
BZIP12
------>
NtERF2
--------->
YAB1
<-------
MYC3
--------->
DEAR3(1)
<---------
YAB1
>>>>>>>>>>
ABI5
------>
NtERF2
--------->
ICU4
------->
MYC3
--------->
DEAR3(1)
--------->
YAB1
--------->
ICU4
<---------
O2
------>
ZmHOX2a(2)
--------->
ATHB12
<---------
ICU4
--------->
TGA1a
--------->
DREB2C(2)
--------->
ICU4
<---------
ICU4
<---------
YAB1
<---------
TGA1a
--------->
ORA47(2)
--------->
bZIP60(1)
--------->
ICU4
------>
NtERF2
<---------
ARR11(3)
<---------
bZIP60(1)
--------->
YAB1
--------->
DEAR3(1)
<---------
ALFIN1
--------->
TGA1a
<---------
ICU4
<---------
ATHB12
--------->
ANAC58
--------->
ARR11(3)
<---------
TGA1a
<---------
YAB1
-------
ALFIN1
--------->
AHL20(2)
--------->
O2
<------
ZmHOX2a(2)
<---------
O2
--------->
ICU4
-----
ALFIN1
<---------
YAB1
--------->
ANAC58
--------->
AGP1
--------->
O2
----------->
GT1
acatcccatcataattttgataaaatgaagactcgccaacgtgtcaacagatctagcaccgccaacttctcacatggcatcatgggttattattattata
6406600
--------->
LBD16
<---------
LBD16
-------->
HAHB4
------>
NtERF2
<---------
ICU4
--------->
bZIP60(1)
--------->
YAB1
--------->
ANAC46
--------->
ICU4
--------->
AHL20(2)
<---------
bZIP60(1)
--------->
YAB1
<---------
AHL20(2)
--------->
ANAC58
--------->
YAB1
--------------->
AGL15
--------->
ANAC46
<----------
DOF2
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
------------>
CBF
------->
TEIL
<---------
YAB1
---------->
ID1
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
TOE2(3)
--------->
ARR14(2)
<-----------
GT1
--------->
TOE2(3)
------>
MYB46(1)
<---------
ARR14(2)
<---------
DAG2
<---------
AHL20(2)
<--
-
YAB1
------>
MYB83
--------->
ANAC58
<---------
YAB1
<----------
DOF2
--------->
AHL20(2)
<-----
cacacttactaaaaccaacttcaatacgacgccatgtatccgcgttttgataataatgctcactttttcctatttaaataaatccttcattttcctcctt
6406700
---
<---------
ICU4
----
--------->
ANAC58
xxxxxxxxx
--------->
ANAC58
----------->
HVH21
--------->
ANAC58
<----------
DOF2
-----------
--------->
ANAC58
--------->
ANAC58
------>
ZmHOX2a(2)
--------->
ARR14(2)
--------->
ANAC58
--------->
DAG2
==================================
*
TSS
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
MYB52(1)
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx>
smallRNA(fl3)
===============
---------
GT1
<---------
MYB52(2)
---------->
DOF2
--------->
ARR11(3)
------>
ZmHOX2a(2)
-----
DOF2
--------->
ANAC46
--------->
ZAT6
---------->
DOF2
<---------
ARR11(3)
--------->
At4g35610
tt
acatttcctcactcaactctctcattctcactaacagagagaaaaagcaaaagcaaaa
atggctcgatctttcgctattgctgtgatctgtatcgtcc
6406800
--------->
ZAT2
<----------
DOF2
--------->
REM1(1)
<-----------
HVH21
------->
GAMYB
<------
NtERF2
--------->
ANAC46
--------->
LBD16
--------->
MYB46(3)
------>
NtERF2
-------->
P
<---------
At4g35610
<---------
ATERF1(1)
------>
MYB83
<---------
ZAT2
--------->
ATERF1(2)
--------->
MYB52(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
ATERF1(2)
--------->
MYB55(1)
------>
MYB46(1)
----
--------->
DEAR3(1)
<---------
MYB55(2)
------>
MYB83
<---------
ALFIN1
<---------
DEAR3(1)
--------->
MYB46(3)
-------->
P
--------->
RAP2.6(2)
<---------
LBD16
<---------
MYB111(1)
--------->
MYB46(3)
--------->
At4g35610
--------->
ATERF1(1)
<---------
MYB46(2)
--------->
AtMYB61
--------->
ZAT2
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR3(1)
--------->
MYB46(3)
--------->
At4g35610
----------->
RAV1(1)
<--
------->
CDC5
------>
NtERF2
------>
MYB46(1)
<---------
MYB111(2)
--------->
ANAC46
======
-->
ZmHOX2a(1)
<---------
ZAT2
<---------
MYB111(2)
<---------
MYB55(2)
======================
xxxxxxx>
smallRNA(s)
--------->
ZAT2
<---------
ALFIN1
<---------
MYB111(1)
=========================
---------->
WRI1
--------->
ANAC58
--------->
DEAR3(1)
<---------
ALFIN1
----------->
RAV1(1)
------
===
HOX2a_HOX2a
--------->
ANAC58
--------->
AtMYB61
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
<-------
===
HOX2a_HOX2a
--------->
WRKY18(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
tcatcgccggcgttactggtcaagctccgacttcaccaccaaccgctacaccagctccaccaactccaacaactcctccaccagcagcaactcctcctcc
6406900
----------->
RAV1(1)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
--------->
DEAR3(1)
--------->
AtMYB61
--------->
AtMYB61
--------->
DEAR3(1)
--------->
MYB46(3)
--------->
ANAC46
--------->
At4g35610
--------->
ARR11(3)
xxxxxxxxxxxxxxxx>
smallRNA(s)
<---------
At4g35610
<---------
ARR11(3)
--------->
ANAC58
-->
ZmHOX2a(1)
--------->
YAB1
--------->
ANAC58
---------
HVH21
<-----------
HVH21
<---------
ALFIN1
<---------
ARR14(2)
=======================
RAV
--------->
AtMYB61
--------->
ARR14(2)
------>
ZmHOX2a(1)
======
RAV
--------->
AtMYB61
--------->
MYB46(3)
--------->
GLK1(1)
----------
======
RAV
<---------
ALFIN1
<-----------
HVH21
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
AtMYB61
------>
ZmHOX2a(1)
----->
RAV1(2)
--------->
ANAC46
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
--
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
--------->
MYB46(3)
------>
ZmHOX2a(1)
tgtctcagcaccaccaccagtcacaacatctcctcctccagtcaccactgctcctcctccagcaaatccaccaccaccagtctcttctcctcctcctgct
6407000
<---------
TGA1a
<---------
O2
--------->
O2
--------->
ANAC58
--------->
At4g35610
<---------
ANAC58
--------->
TGA1a
----
<---------
At4g35610
<---------
ANAC58
--------->
ANAC46
<---
--------->
ANAC46
<---------
MYB52(1)
<---------
ALFIN1
<----
--------->
ANAC58
==========================================
MYC_MYB
-----
--------->
ANAC58
<-------
GAMYB
--------->
ANAC46
<----
--------->
MYB46(3)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
ANAC58
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
<---------
ALFIN1
----------->
RAV1(1)
<-----------
HVH21
-----
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
<------
--------->
ANAC46
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
<---------
ALFIN1
--------
->
RAV1(2)
<---------
ALFIN1
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
ANAC46
------>
ZmHOX2a(1)
------>
ZmHOX2a(1)
tctcctccaccagctactcctcctccagtcgcttctcctcctcctcccgttgcttctcctccaccagcaactcctcctcccgtcgctactcctcccccag
6407100
--------->
GLK1(2)
------>
MYB83
<---------
GLK1(2)
------>
MYB46(1)
--------->
ORA47(1)
--------->
MYB46(3)
<---------
MYB46(2)
<---------
MYB55(2)
<---------
MYB111(1)
----------->
HVH21
<---------
ANAC58
--------->
DEAR3(1)
<---------
ANAC58
--------->
DREB2C(2)
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
DEAR4(1)
----->
ARR14(2)
--------->
DEAR3(2)
<-----------
GT1
------
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
--------->
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
-----
At4g35610
--------->
ZAT2
<---------
ARR14(2)
<---------
ALFIN1
---->
At4g35610
<---------
At4g35610
--------->
ANAC58
<---------
MYB52(1)
-
-----
ZAT2
<---------
ZAT2
--------->
ANAC46
<-----------
HVH21
---
---->
ZAT2
------>
ZmHOX2a(1)
--------->
ZAT2
----------->
ARR10
<-----------
TGA1
---
---
ALFIN1
----------->
RAV1(2)
<---------
ZAT2
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxx>
smallRNA(fl3)
<---------
ZAT18
---
->
LBD16
<---------
ALFIN1
--------->
At4g35610
--------->
ANAC58
--------->
ANAC46
-----
ctcctctagcttcccctcctgctcaagttccagctccagcaccgaccacgaagccagattctccatctccatctccgtcatctagcccacctcttccatc
6407200
Previous
Next
AGI:
At2g14890.1
Description:
AGP9 (ARABINOGALACTAN PROTEIN 9). Identical to Classical arabinogalactan protein 9 precursor (AGP9) [Arabidopsis Thaliana] (GB:Q9C5S0;GB:O82327); contains InterPro domain Glutelin; (InterPro:IPR000480)
Range:
from: 6406703
to: 6408141
Orientation: Forward
Links:
TAIR
MIPS
Please cite the corresponding
publications
when using AthaMap.
printer-friendly version